Protein–RNA interactions for Protein: O55106

Strn, Striatin, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StrnO55106 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
StrnO55106 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
StrnO55106 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
StrnO55106 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
StrnO55106 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
StrnO55106 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
StrnO55106 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
StrnO55106 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
StrnO55106 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
StrnO55106 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
StrnO55106 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
StrnO55106 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
StrnO55106 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
StrnO55106 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
StrnO55106 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
StrnO55106 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
StrnO55106 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
StrnO55106 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
StrnO55106 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
StrnO55106 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
StrnO55106 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
StrnO55106 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
StrnO55106 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
StrnO55106 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
StrnO55106 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
StrnO55106 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
StrnO55106 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
StrnO55106 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
StrnO55106 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
StrnO55106 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
StrnO55106 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
StrnO55106 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
StrnO55106 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
StrnO55106 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
StrnO55106 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
StrnO55106 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
StrnO55106 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
StrnO55106 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
StrnO55106 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
StrnO55106 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
StrnO55106 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
StrnO55106 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
StrnO55106 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
StrnO55106 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
StrnO55106 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
StrnO55106 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
StrnO55106 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
StrnO55106 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
StrnO55106 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
StrnO55106 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
StrnO55106 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
StrnO55106 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
StrnO55106 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
StrnO55106 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
StrnO55106 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
StrnO55106 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
StrnO55106 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
StrnO55106 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
StrnO55106 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
StrnO55106 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
StrnO55106 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
StrnO55106 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
StrnO55106 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
StrnO55106 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
StrnO55106 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
StrnO55106 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
StrnO55106 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
StrnO55106 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
StrnO55106 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
StrnO55106 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
StrnO55106 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
StrnO55106 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
StrnO55106 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
StrnO55106 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
StrnO55106 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
StrnO55106 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
StrnO55106 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
StrnO55106 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
StrnO55106 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
StrnO55106 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
StrnO55106 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
StrnO55106 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
StrnO55106 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
StrnO55106 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
StrnO55106 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
StrnO55106 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
StrnO55106 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
StrnO55106 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
StrnO55106 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
StrnO55106 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
StrnO55106 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
StrnO55106 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
StrnO55106 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
StrnO55106 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
StrnO55106 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
StrnO55106 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
StrnO55106 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
StrnO55106 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
StrnO55106 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
StrnO55106 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms