Protein–RNA interactions for Protein: O54946

Dnajb6, DnaJ homolog subfamily B member 6, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajb6O54946 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Dnajb6O54946 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Dnajb6O54946 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Dnajb6O54946 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Dnajb6O54946 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Dnajb6O54946 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Dnajb6O54946 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Dnajb6O54946 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Dnajb6O54946 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Dnajb6O54946 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Dnajb6O54946 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Dnajb6O54946 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Dnajb6O54946 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Dnajb6O54946 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Dnajb6O54946 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Dnajb6O54946 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Dnajb6O54946 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Dnajb6O54946 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Dnajb6O54946 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Dnajb6O54946 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Dnajb6O54946 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Dnajb6O54946 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Dnajb6O54946 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Dnajb6O54946 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Dnajb6O54946 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Dnajb6O54946 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Dnajb6O54946 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Dnajb6O54946 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Dnajb6O54946 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Dnajb6O54946 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Dnajb6O54946 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Dnajb6O54946 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Dnajb6O54946 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Dnajb6O54946 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Dnajb6O54946 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Dnajb6O54946 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Dnajb6O54946 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Dnajb6O54946 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Dnajb6O54946 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Dnajb6O54946 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Dnajb6O54946 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Dnajb6O54946 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Dnajb6O54946 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Dnajb6O54946 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Dnajb6O54946 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Dnajb6O54946 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Dnajb6O54946 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Dnajb6O54946 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Dnajb6O54946 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Dnajb6O54946 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Dnajb6O54946 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Dnajb6O54946 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Dnajb6O54946 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Dnajb6O54946 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Dnajb6O54946 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Dnajb6O54946 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Dnajb6O54946 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Dnajb6O54946 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Dnajb6O54946 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Dnajb6O54946 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Dnajb6O54946 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Dnajb6O54946 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Dnajb6O54946 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Dnajb6O54946 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Dnajb6O54946 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Dnajb6O54946 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Dnajb6O54946 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Dnajb6O54946 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Dnajb6O54946 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Dnajb6O54946 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Dnajb6O54946 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Dnajb6O54946 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Dnajb6O54946 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Dnajb6O54946 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Dnajb6O54946 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Dnajb6O54946 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Dnajb6O54946 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Dnajb6O54946 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Dnajb6O54946 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Dnajb6O54946 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Dnajb6O54946 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Dnajb6O54946 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Dnajb6O54946 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Dnajb6O54946 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Dnajb6O54946 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Dnajb6O54946 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Dnajb6O54946 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Dnajb6O54946 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Dnajb6O54946 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Dnajb6O54946 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Dnajb6O54946 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Dnajb6O54946 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Dnajb6O54946 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Dnajb6O54946 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Dnajb6O54946 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Dnajb6O54946 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Dnajb6O54946 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Dnajb6O54946 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Dnajb6O54946 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Dnajb6O54946 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms