Protein–RNA interactions for Protein: O35864

Cops5, COP9 signalosome complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops5O35864 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cops5O35864 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cops5O35864 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cops5O35864 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cops5O35864 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cops5O35864 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cops5O35864 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cops5O35864 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cops5O35864 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cops5O35864 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cops5O35864 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cops5O35864 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cops5O35864 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Cops5O35864 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cops5O35864 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cops5O35864 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Cops5O35864 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cops5O35864 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Cops5O35864 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cops5O35864 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Cops5O35864 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cops5O35864 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Cops5O35864 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cops5O35864 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cops5O35864 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cops5O35864 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cops5O35864 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cops5O35864 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cops5O35864 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cops5O35864 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cops5O35864 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cops5O35864 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cops5O35864 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cops5O35864 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cops5O35864 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cops5O35864 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cops5O35864 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cops5O35864 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cops5O35864 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cops5O35864 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cops5O35864 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cops5O35864 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cops5O35864 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cops5O35864 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cops5O35864 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cops5O35864 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cops5O35864 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cops5O35864 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cops5O35864 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cops5O35864 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cops5O35864 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cops5O35864 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cops5O35864 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cops5O35864 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cops5O35864 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cops5O35864 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cops5O35864 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cops5O35864 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cops5O35864 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cops5O35864 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cops5O35864 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Cops5O35864 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cops5O35864 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cops5O35864 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cops5O35864 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Cops5O35864 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cops5O35864 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cops5O35864 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cops5O35864 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cops5O35864 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cops5O35864 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Cops5O35864 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cops5O35864 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cops5O35864 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cops5O35864 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cops5O35864 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Cops5O35864 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Cops5O35864 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Cops5O35864 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Cops5O35864 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cops5O35864 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Cops5O35864 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cops5O35864 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cops5O35864 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cops5O35864 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Cops5O35864 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Cops5O35864 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cops5O35864 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cops5O35864 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cops5O35864 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cops5O35864 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Cops5O35864 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cops5O35864 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cops5O35864 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cops5O35864 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cops5O35864 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cops5O35864 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cops5O35864 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cops5O35864 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cops5O35864 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms