Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc27a2O35488 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc27a2O35488 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc27a2O35488 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc27a2O35488 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc27a2O35488 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc27a2O35488 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc27a2O35488 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Slc27a2O35488 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Slc27a2O35488 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Slc27a2O35488 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc27a2O35488 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc27a2O35488 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc27a2O35488 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc27a2O35488 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc27a2O35488 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc27a2O35488 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc27a2O35488 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc27a2O35488 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc27a2O35488 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc27a2O35488 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc27a2O35488 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc27a2O35488 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc27a2O35488 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc27a2O35488 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc27a2O35488 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc27a2O35488 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Slc27a2O35488 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc27a2O35488 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc27a2O35488 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc27a2O35488 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc27a2O35488 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc27a2O35488 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc27a2O35488 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc27a2O35488 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc27a2O35488 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc27a2O35488 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc27a2O35488 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc27a2O35488 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc27a2O35488 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc27a2O35488 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc27a2O35488 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc27a2O35488 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc27a2O35488 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc27a2O35488 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc27a2O35488 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc27a2O35488 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc27a2O35488 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc27a2O35488 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc27a2O35488 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc27a2O35488 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc27a2O35488 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc27a2O35488 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc27a2O35488 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc27a2O35488 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc27a2O35488 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc27a2O35488 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc27a2O35488 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc27a2O35488 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc27a2O35488 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc27a2O35488 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc27a2O35488 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc27a2O35488 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc27a2O35488 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc27a2O35488 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc27a2O35488 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc27a2O35488 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc27a2O35488 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc27a2O35488 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc27a2O35488 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc27a2O35488 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc27a2O35488 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc27a2O35488 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc27a2O35488 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc27a2O35488 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc27a2O35488 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc27a2O35488 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc27a2O35488 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc27a2O35488 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc27a2O35488 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc27a2O35488 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc27a2O35488 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc27a2O35488 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc27a2O35488 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc27a2O35488 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc27a2O35488 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc27a2O35488 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc27a2O35488 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc27a2O35488 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc27a2O35488 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc27a2O35488 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc27a2O35488 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc27a2O35488 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc27a2O35488 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc27a2O35488 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc27a2O35488 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc27a2O35488 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc27a2O35488 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc27a2O35488 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slc27a2O35488 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.9 ms