Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Edil3O35474 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Edil3O35474 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Edil3O35474 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Edil3O35474 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Edil3O35474 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Edil3O35474 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Edil3O35474 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Edil3O35474 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Edil3O35474 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Edil3O35474 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Edil3O35474 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Edil3O35474 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Edil3O35474 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Edil3O35474 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Edil3O35474 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Edil3O35474 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Edil3O35474 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Edil3O35474 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Edil3O35474 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Edil3O35474 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Edil3O35474 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Edil3O35474 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Edil3O35474 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Edil3O35474 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Edil3O35474 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Edil3O35474 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Edil3O35474 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Edil3O35474 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Edil3O35474 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Edil3O35474 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Edil3O35474 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Edil3O35474 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Edil3O35474 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Edil3O35474 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Edil3O35474 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Edil3O35474 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Edil3O35474 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Edil3O35474 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Edil3O35474 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Edil3O35474 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Edil3O35474 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Edil3O35474 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Edil3O35474 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Edil3O35474 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Edil3O35474 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Edil3O35474 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Edil3O35474 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Edil3O35474 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Edil3O35474 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Edil3O35474 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Edil3O35474 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Edil3O35474 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Edil3O35474 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Edil3O35474 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Edil3O35474 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Edil3O35474 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Edil3O35474 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Edil3O35474 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Edil3O35474 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Edil3O35474 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Edil3O35474 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Edil3O35474 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Edil3O35474 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Edil3O35474 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Edil3O35474 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Edil3O35474 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Edil3O35474 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Edil3O35474 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Edil3O35474 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Edil3O35474 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Edil3O35474 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Edil3O35474 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Edil3O35474 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Edil3O35474 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Edil3O35474 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Edil3O35474 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Edil3O35474 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Edil3O35474 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Edil3O35474 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Edil3O35474 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Edil3O35474 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Edil3O35474 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Edil3O35474 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Edil3O35474 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Edil3O35474 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Edil3O35474 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Edil3O35474 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Edil3O35474 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Edil3O35474 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Edil3O35474 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Edil3O35474 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Edil3O35474 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Edil3O35474 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Edil3O35474 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Edil3O35474 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Edil3O35474 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Edil3O35474 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Edil3O35474 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Edil3O35474 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms