Protein–RNA interactions for Protein: O35324

Sh2d1b, SH2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1bO35324 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh2d1bO35324 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh2d1bO35324 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh2d1bO35324 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh2d1bO35324 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh2d1bO35324 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh2d1bO35324 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh2d1bO35324 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh2d1bO35324 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh2d1bO35324 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh2d1bO35324 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh2d1bO35324 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh2d1bO35324 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh2d1bO35324 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sh2d1bO35324 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh2d1bO35324 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh2d1bO35324 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh2d1bO35324 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh2d1bO35324 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh2d1bO35324 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sh2d1bO35324 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh2d1bO35324 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh2d1bO35324 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh2d1bO35324 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh2d1bO35324 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh2d1bO35324 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh2d1bO35324 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh2d1bO35324 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh2d1bO35324 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh2d1bO35324 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh2d1bO35324 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh2d1bO35324 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh2d1bO35324 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh2d1bO35324 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh2d1bO35324 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh2d1bO35324 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Sh2d1bO35324 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sh2d1bO35324 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sh2d1bO35324 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sh2d1bO35324 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Sh2d1bO35324 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sh2d1bO35324 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sh2d1bO35324 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh2d1bO35324 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh2d1bO35324 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh2d1bO35324 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh2d1bO35324 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh2d1bO35324 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sh2d1bO35324 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Sh2d1bO35324 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sh2d1bO35324 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sh2d1bO35324 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sh2d1bO35324 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sh2d1bO35324 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sh2d1bO35324 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sh2d1bO35324 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh2d1bO35324 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh2d1bO35324 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh2d1bO35324 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh2d1bO35324 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sh2d1bO35324 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sh2d1bO35324 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Sh2d1bO35324 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sh2d1bO35324 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sh2d1bO35324 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sh2d1bO35324 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sh2d1bO35324 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sh2d1bO35324 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sh2d1bO35324 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sh2d1bO35324 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sh2d1bO35324 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh2d1bO35324 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh2d1bO35324 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh2d1bO35324 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh2d1bO35324 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sh2d1bO35324 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sh2d1bO35324 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sh2d1bO35324 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sh2d1bO35324 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Sh2d1bO35324 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sh2d1bO35324 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sh2d1bO35324 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sh2d1bO35324 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh2d1bO35324 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh2d1bO35324 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh2d1bO35324 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh2d1bO35324 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh2d1bO35324 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh2d1bO35324 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh2d1bO35324 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh2d1bO35324 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh2d1bO35324 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh2d1bO35324 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh2d1bO35324 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh2d1bO35324 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh2d1bO35324 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh2d1bO35324 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh2d1bO35324 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh2d1bO35324 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh2d1bO35324 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms