Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nedd9O35177 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nedd9O35177 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Nedd9O35177 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nedd9O35177 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nedd9O35177 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Nedd9O35177 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nedd9O35177 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nedd9O35177 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nedd9O35177 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nedd9O35177 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nedd9O35177 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nedd9O35177 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nedd9O35177 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nedd9O35177 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nedd9O35177 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nedd9O35177 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nedd9O35177 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nedd9O35177 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nedd9O35177 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nedd9O35177 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nedd9O35177 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nedd9O35177 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nedd9O35177 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nedd9O35177 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nedd9O35177 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nedd9O35177 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nedd9O35177 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nedd9O35177 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nedd9O35177 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nedd9O35177 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nedd9O35177 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nedd9O35177 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nedd9O35177 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nedd9O35177 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nedd9O35177 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nedd9O35177 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nedd9O35177 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nedd9O35177 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nedd9O35177 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nedd9O35177 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nedd9O35177 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nedd9O35177 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nedd9O35177 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nedd9O35177 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nedd9O35177 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nedd9O35177 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nedd9O35177 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nedd9O35177 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nedd9O35177 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nedd9O35177 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nedd9O35177 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Nedd9O35177 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nedd9O35177 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Nedd9O35177 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nedd9O35177 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nedd9O35177 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Nedd9O35177 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nedd9O35177 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nedd9O35177 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nedd9O35177 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nedd9O35177 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nedd9O35177 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nedd9O35177 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nedd9O35177 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nedd9O35177 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Nedd9O35177 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nedd9O35177 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nedd9O35177 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nedd9O35177 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nedd9O35177 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nedd9O35177 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nedd9O35177 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nedd9O35177 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nedd9O35177 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nedd9O35177 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nedd9O35177 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nedd9O35177 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nedd9O35177 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nedd9O35177 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nedd9O35177 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nedd9O35177 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nedd9O35177 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nedd9O35177 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Nedd9O35177 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Nedd9O35177 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nedd9O35177 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nedd9O35177 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Nedd9O35177 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nedd9O35177 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nedd9O35177 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nedd9O35177 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nedd9O35177 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nedd9O35177 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nedd9O35177 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Nedd9O35177 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Nedd9O35177 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nedd9O35177 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nedd9O35177 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nedd9O35177 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms