Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Polr1aO35134 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Polr1aO35134 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
Polr1aO35134 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
Polr1aO35134 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
Polr1aO35134 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
Polr1aO35134 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Polr1aO35134 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Polr1aO35134 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Polr1aO35134 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Polr1aO35134 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
Polr1aO35134 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
Polr1aO35134 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Polr1aO35134 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Polr1aO35134 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Polr1aO35134 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Polr1aO35134 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Polr1aO35134 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Polr1aO35134 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Polr1aO35134 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Polr1aO35134 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Polr1aO35134 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Polr1aO35134 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Polr1aO35134 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
Polr1aO35134 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Polr1aO35134 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Polr1aO35134 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
Polr1aO35134 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
Polr1aO35134 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
Polr1aO35134 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
Polr1aO35134 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.54
Polr1aO35134 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Polr1aO35134 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
Polr1aO35134 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Polr1aO35134 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Polr1aO35134 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Polr1aO35134 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Polr1aO35134 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Polr1aO35134 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Polr1aO35134 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Polr1aO35134 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Polr1aO35134 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Polr1aO35134 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
Polr1aO35134 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Polr1aO35134 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Polr1aO35134 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC37.08■■■■□ 3.53
Polr1aO35134 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.53
Polr1aO35134 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
Polr1aO35134 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC37.06■■■■□ 3.52
Polr1aO35134 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Polr1aO35134 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Polr1aO35134 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Polr1aO35134 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
Polr1aO35134 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC37.03■■■■□ 3.52
Polr1aO35134 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Polr1aO35134 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Polr1aO35134 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Polr1aO35134 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Polr1aO35134 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Polr1aO35134 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.51
Polr1aO35134 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
Polr1aO35134 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
Polr1aO35134 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Polr1aO35134 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Polr1aO35134 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Polr1aO35134 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
Polr1aO35134 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
Polr1aO35134 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
Polr1aO35134 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Polr1aO35134 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Polr1aO35134 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Polr1aO35134 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Polr1aO35134 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Polr1aO35134 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Polr1aO35134 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Polr1aO35134 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Polr1aO35134 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Polr1aO35134 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Polr1aO35134 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Polr1aO35134 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Polr1aO35134 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Polr1aO35134 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Polr1aO35134 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Polr1aO35134 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Polr1aO35134 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Polr1aO35134 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
Polr1aO35134 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
Polr1aO35134 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Polr1aO35134 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
Polr1aO35134 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Polr1aO35134 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
Polr1aO35134 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Polr1aO35134 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
Polr1aO35134 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Polr1aO35134 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Polr1aO35134 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Polr1aO35134 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Polr1aO35134 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Polr1aO35134 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
Polr1aO35134 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms