Protein–RNA interactions for Protein: O09127

Epha8, Ephrin type-A receptor 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha8O09127 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Epha8O09127 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Epha8O09127 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Epha8O09127 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Epha8O09127 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Epha8O09127 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Epha8O09127 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Epha8O09127 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Epha8O09127 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Epha8O09127 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Epha8O09127 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Epha8O09127 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Epha8O09127 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Epha8O09127 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Epha8O09127 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Epha8O09127 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Epha8O09127 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Epha8O09127 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Epha8O09127 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Epha8O09127 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Epha8O09127 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Epha8O09127 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Epha8O09127 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Epha8O09127 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Epha8O09127 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Epha8O09127 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Epha8O09127 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Epha8O09127 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Epha8O09127 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Epha8O09127 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Epha8O09127 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Epha8O09127 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Epha8O09127 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Epha8O09127 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Epha8O09127 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Epha8O09127 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Epha8O09127 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Epha8O09127 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Epha8O09127 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Epha8O09127 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Epha8O09127 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Epha8O09127 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Epha8O09127 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Epha8O09127 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Epha8O09127 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Epha8O09127 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Epha8O09127 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Epha8O09127 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Epha8O09127 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Epha8O09127 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Epha8O09127 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Epha8O09127 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Epha8O09127 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Epha8O09127 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Epha8O09127 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Epha8O09127 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Epha8O09127 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Epha8O09127 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Epha8O09127 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Epha8O09127 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Epha8O09127 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Epha8O09127 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Epha8O09127 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Epha8O09127 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Epha8O09127 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Epha8O09127 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Epha8O09127 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Epha8O09127 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Epha8O09127 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Epha8O09127 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Epha8O09127 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Epha8O09127 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Epha8O09127 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Epha8O09127 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Epha8O09127 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Epha8O09127 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Epha8O09127 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Epha8O09127 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Epha8O09127 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Epha8O09127 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Epha8O09127 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Epha8O09127 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Epha8O09127 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Epha8O09127 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Epha8O09127 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Epha8O09127 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Epha8O09127 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Epha8O09127 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Epha8O09127 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Epha8O09127 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Epha8O09127 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Epha8O09127 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Epha8O09127 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Epha8O09127 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Epha8O09127 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Epha8O09127 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Epha8O09127 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Epha8O09127 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Epha8O09127 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Epha8O09127 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 250.8 ms