Protein–RNA interactions for Protein: O08786

Cckar, Cholecystokinin receptor type A, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckarO08786 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CckarO08786 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CckarO08786 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CckarO08786 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CckarO08786 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CckarO08786 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CckarO08786 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CckarO08786 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CckarO08786 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CckarO08786 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CckarO08786 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CckarO08786 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CckarO08786 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CckarO08786 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CckarO08786 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CckarO08786 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CckarO08786 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CckarO08786 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CckarO08786 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CckarO08786 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CckarO08786 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CckarO08786 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CckarO08786 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CckarO08786 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CckarO08786 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CckarO08786 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CckarO08786 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CckarO08786 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CckarO08786 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CckarO08786 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CckarO08786 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CckarO08786 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CckarO08786 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CckarO08786 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CckarO08786 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CckarO08786 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CckarO08786 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CckarO08786 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CckarO08786 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CckarO08786 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CckarO08786 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CckarO08786 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CckarO08786 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CckarO08786 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CckarO08786 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CckarO08786 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CckarO08786 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CckarO08786 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CckarO08786 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CckarO08786 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CckarO08786 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CckarO08786 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CckarO08786 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CckarO08786 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CckarO08786 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CckarO08786 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CckarO08786 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CckarO08786 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CckarO08786 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CckarO08786 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CckarO08786 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CckarO08786 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CckarO08786 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CckarO08786 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CckarO08786 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CckarO08786 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CckarO08786 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CckarO08786 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CckarO08786 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CckarO08786 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CckarO08786 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CckarO08786 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CckarO08786 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CckarO08786 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CckarO08786 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CckarO08786 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CckarO08786 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CckarO08786 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CckarO08786 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CckarO08786 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CckarO08786 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CckarO08786 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CckarO08786 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CckarO08786 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CckarO08786 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CckarO08786 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CckarO08786 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CckarO08786 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CckarO08786 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CckarO08786 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CckarO08786 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CckarO08786 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CckarO08786 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CckarO08786 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CckarO08786 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CckarO08786 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CckarO08786 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CckarO08786 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CckarO08786 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CckarO08786 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms