Protein–RNA interactions for Protein: O08740

Polr2j, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2jO08740 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Polr2jO08740 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Polr2jO08740 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Polr2jO08740 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Polr2jO08740 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Polr2jO08740 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Polr2jO08740 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Polr2jO08740 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Polr2jO08740 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Polr2jO08740 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Polr2jO08740 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Polr2jO08740 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Polr2jO08740 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Polr2jO08740 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Polr2jO08740 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Polr2jO08740 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Polr2jO08740 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Polr2jO08740 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Polr2jO08740 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Polr2jO08740 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Polr2jO08740 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Polr2jO08740 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr2jO08740 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr2jO08740 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr2jO08740 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr2jO08740 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr2jO08740 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr2jO08740 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr2jO08740 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr2jO08740 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr2jO08740 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Polr2jO08740 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Polr2jO08740 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Polr2jO08740 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr2jO08740 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr2jO08740 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr2jO08740 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr2jO08740 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr2jO08740 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr2jO08740 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Polr2jO08740 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Polr2jO08740 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Polr2jO08740 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Polr2jO08740 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Polr2jO08740 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Polr2jO08740 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr2jO08740 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr2jO08740 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr2jO08740 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Polr2jO08740 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Polr2jO08740 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Polr2jO08740 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Polr2jO08740 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Polr2jO08740 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Polr2jO08740 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Polr2jO08740 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Polr2jO08740 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Polr2jO08740 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Polr2jO08740 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Polr2jO08740 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Polr2jO08740 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Polr2jO08740 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Polr2jO08740 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Polr2jO08740 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Polr2jO08740 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Polr2jO08740 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Polr2jO08740 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Polr2jO08740 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Polr2jO08740 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Polr2jO08740 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Polr2jO08740 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Polr2jO08740 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Polr2jO08740 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Polr2jO08740 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Polr2jO08740 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Polr2jO08740 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr2jO08740 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr2jO08740 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr2jO08740 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr2jO08740 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr2jO08740 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr2jO08740 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr2jO08740 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr2jO08740 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Polr2jO08740 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Polr2jO08740 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Polr2jO08740 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Polr2jO08740 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Polr2jO08740 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Polr2jO08740 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Polr2jO08740 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Polr2jO08740 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Polr2jO08740 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Polr2jO08740 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Polr2jO08740 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Polr2jO08740 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Polr2jO08740 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Polr2jO08740 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Polr2jO08740 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Polr2jO08740 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms