Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp35M0QWN7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp35M0QWN7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp35M0QWN7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp35M0QWN7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp35M0QWN7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp35M0QWN7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp35M0QWN7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp35M0QWN7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp35M0QWN7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp35M0QWN7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp35M0QWN7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp35M0QWN7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp35M0QWN7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp35M0QWN7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp35M0QWN7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp35M0QWN7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp35M0QWN7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp35M0QWN7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp35M0QWN7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp35M0QWN7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp35M0QWN7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp35M0QWN7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp35M0QWN7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp35M0QWN7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp35M0QWN7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp35M0QWN7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp35M0QWN7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp35M0QWN7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp35M0QWN7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp35M0QWN7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp35M0QWN7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp35M0QWN7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp35M0QWN7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp35M0QWN7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp35M0QWN7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp35M0QWN7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp35M0QWN7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp35M0QWN7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp35M0QWN7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp35M0QWN7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp35M0QWN7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Usp35M0QWN7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp35M0QWN7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp35M0QWN7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp35M0QWN7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp35M0QWN7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp35M0QWN7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp35M0QWN7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp35M0QWN7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp35M0QWN7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp35M0QWN7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp35M0QWN7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp35M0QWN7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp35M0QWN7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp35M0QWN7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp35M0QWN7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp35M0QWN7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp35M0QWN7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp35M0QWN7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp35M0QWN7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp35M0QWN7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp35M0QWN7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp35M0QWN7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp35M0QWN7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp35M0QWN7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp35M0QWN7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp35M0QWN7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp35M0QWN7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp35M0QWN7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp35M0QWN7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp35M0QWN7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp35M0QWN7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp35M0QWN7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp35M0QWN7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp35M0QWN7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp35M0QWN7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp35M0QWN7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp35M0QWN7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp35M0QWN7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp35M0QWN7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp35M0QWN7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp35M0QWN7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp35M0QWN7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp35M0QWN7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp35M0QWN7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp35M0QWN7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp35M0QWN7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp35M0QWN7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp35M0QWN7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp35M0QWN7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp35M0QWN7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp35M0QWN7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp35M0QWN7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp35M0QWN7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp35M0QWN7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp35M0QWN7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp35M0QWN7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp35M0QWN7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp35M0QWN7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
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