Protein–RNA interactions for Protein: I3ITR1

AK157302, MCG50313, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AK157302I3ITR1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
AK157302I3ITR1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
AK157302I3ITR1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
AK157302I3ITR1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
AK157302I3ITR1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
AK157302I3ITR1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
AK157302I3ITR1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
AK157302I3ITR1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
AK157302I3ITR1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
AK157302I3ITR1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
AK157302I3ITR1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
AK157302I3ITR1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
AK157302I3ITR1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
AK157302I3ITR1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
AK157302I3ITR1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
AK157302I3ITR1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
AK157302I3ITR1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
AK157302I3ITR1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
AK157302I3ITR1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
AK157302I3ITR1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
AK157302I3ITR1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
AK157302I3ITR1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
AK157302I3ITR1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
AK157302I3ITR1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
AK157302I3ITR1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
AK157302I3ITR1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
AK157302I3ITR1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
AK157302I3ITR1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
AK157302I3ITR1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
AK157302I3ITR1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
AK157302I3ITR1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
AK157302I3ITR1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
AK157302I3ITR1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
AK157302I3ITR1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
AK157302I3ITR1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
AK157302I3ITR1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
AK157302I3ITR1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
AK157302I3ITR1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
AK157302I3ITR1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
AK157302I3ITR1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
AK157302I3ITR1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
AK157302I3ITR1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
AK157302I3ITR1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
AK157302I3ITR1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
AK157302I3ITR1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
AK157302I3ITR1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
AK157302I3ITR1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
AK157302I3ITR1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
AK157302I3ITR1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
AK157302I3ITR1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
AK157302I3ITR1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
AK157302I3ITR1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
AK157302I3ITR1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
AK157302I3ITR1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
AK157302I3ITR1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
AK157302I3ITR1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
AK157302I3ITR1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
AK157302I3ITR1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
AK157302I3ITR1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
AK157302I3ITR1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
AK157302I3ITR1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
AK157302I3ITR1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
AK157302I3ITR1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
AK157302I3ITR1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
AK157302I3ITR1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
AK157302I3ITR1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
AK157302I3ITR1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
AK157302I3ITR1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
AK157302I3ITR1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
AK157302I3ITR1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
AK157302I3ITR1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
AK157302I3ITR1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
AK157302I3ITR1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
AK157302I3ITR1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
AK157302I3ITR1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
AK157302I3ITR1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
AK157302I3ITR1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
AK157302I3ITR1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
AK157302I3ITR1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
AK157302I3ITR1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
AK157302I3ITR1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
AK157302I3ITR1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
AK157302I3ITR1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
AK157302I3ITR1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
AK157302I3ITR1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
AK157302I3ITR1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
AK157302I3ITR1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
AK157302I3ITR1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
AK157302I3ITR1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
AK157302I3ITR1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
AK157302I3ITR1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
AK157302I3ITR1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
AK157302I3ITR1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
AK157302I3ITR1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
AK157302I3ITR1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
AK157302I3ITR1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
AK157302I3ITR1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
AK157302I3ITR1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
AK157302I3ITR1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
AK157302I3ITR1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.4 ms