Protein–RNA interactions for Protein: G5E8C1

Vmn1r67, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r67G5E8C1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn1r67G5E8C1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn1r67G5E8C1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn1r67G5E8C1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn1r67G5E8C1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn1r67G5E8C1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn1r67G5E8C1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn1r67G5E8C1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn1r67G5E8C1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn1r67G5E8C1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn1r67G5E8C1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn1r67G5E8C1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn1r67G5E8C1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn1r67G5E8C1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn1r67G5E8C1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn1r67G5E8C1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn1r67G5E8C1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn1r67G5E8C1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn1r67G5E8C1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn1r67G5E8C1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn1r67G5E8C1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn1r67G5E8C1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn1r67G5E8C1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn1r67G5E8C1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r67G5E8C1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r67G5E8C1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r67G5E8C1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r67G5E8C1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r67G5E8C1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r67G5E8C1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r67G5E8C1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r67G5E8C1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r67G5E8C1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r67G5E8C1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r67G5E8C1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r67G5E8C1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r67G5E8C1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r67G5E8C1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Vmn1r67G5E8C1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r67G5E8C1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r67G5E8C1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r67G5E8C1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r67G5E8C1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r67G5E8C1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r67G5E8C1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r67G5E8C1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r67G5E8C1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r67G5E8C1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r67G5E8C1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r67G5E8C1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r67G5E8C1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r67G5E8C1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r67G5E8C1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn1r67G5E8C1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn1r67G5E8C1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn1r67G5E8C1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn1r67G5E8C1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r67G5E8C1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r67G5E8C1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmn1r67G5E8C1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmn1r67G5E8C1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vmn1r67G5E8C1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn1r67G5E8C1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn1r67G5E8C1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn1r67G5E8C1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r67G5E8C1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r67G5E8C1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r67G5E8C1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r67G5E8C1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r67G5E8C1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r67G5E8C1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r67G5E8C1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r67G5E8C1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r67G5E8C1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r67G5E8C1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r67G5E8C1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn1r67G5E8C1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn1r67G5E8C1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn1r67G5E8C1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn1r67G5E8C1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn1r67G5E8C1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn1r67G5E8C1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Vmn1r67G5E8C1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Vmn1r67G5E8C1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmn1r67G5E8C1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmn1r67G5E8C1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmn1r67G5E8C1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmn1r67G5E8C1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vmn1r67G5E8C1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vmn1r67G5E8C1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Vmn1r67G5E8C1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Vmn1r67G5E8C1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vmn1r67G5E8C1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r67G5E8C1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r67G5E8C1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r67G5E8C1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r67G5E8C1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vmn1r67G5E8C1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vmn1r67G5E8C1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vmn1r67G5E8C1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms