Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8N6

Aknad1, AKNA domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aknad1E9Q8N6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Aknad1E9Q8N6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Aknad1E9Q8N6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Aknad1E9Q8N6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Aknad1E9Q8N6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Aknad1E9Q8N6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Aknad1E9Q8N6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Aknad1E9Q8N6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Aknad1E9Q8N6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Aknad1E9Q8N6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Aknad1E9Q8N6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Aknad1E9Q8N6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Aknad1E9Q8N6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Aknad1E9Q8N6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Aknad1E9Q8N6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Aknad1E9Q8N6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Aknad1E9Q8N6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Aknad1E9Q8N6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Aknad1E9Q8N6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Aknad1E9Q8N6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Aknad1E9Q8N6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Aknad1E9Q8N6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Aknad1E9Q8N6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Aknad1E9Q8N6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Aknad1E9Q8N6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Aknad1E9Q8N6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Aknad1E9Q8N6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Aknad1E9Q8N6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Aknad1E9Q8N6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Aknad1E9Q8N6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Aknad1E9Q8N6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Aknad1E9Q8N6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Aknad1E9Q8N6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Aknad1E9Q8N6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Aknad1E9Q8N6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Aknad1E9Q8N6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Aknad1E9Q8N6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Aknad1E9Q8N6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Aknad1E9Q8N6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Aknad1E9Q8N6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Aknad1E9Q8N6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Aknad1E9Q8N6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Aknad1E9Q8N6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Aknad1E9Q8N6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Aknad1E9Q8N6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Aknad1E9Q8N6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Aknad1E9Q8N6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Aknad1E9Q8N6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Aknad1E9Q8N6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Aknad1E9Q8N6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Aknad1E9Q8N6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Aknad1E9Q8N6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Aknad1E9Q8N6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Aknad1E9Q8N6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Aknad1E9Q8N6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Aknad1E9Q8N6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Aknad1E9Q8N6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Aknad1E9Q8N6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Aknad1E9Q8N6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Aknad1E9Q8N6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Aknad1E9Q8N6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Aknad1E9Q8N6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Aknad1E9Q8N6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Aknad1E9Q8N6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Aknad1E9Q8N6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Aknad1E9Q8N6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Aknad1E9Q8N6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Aknad1E9Q8N6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Aknad1E9Q8N6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Aknad1E9Q8N6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Aknad1E9Q8N6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Aknad1E9Q8N6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Aknad1E9Q8N6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Aknad1E9Q8N6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Aknad1E9Q8N6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Aknad1E9Q8N6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Aknad1E9Q8N6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Aknad1E9Q8N6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Aknad1E9Q8N6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Aknad1E9Q8N6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Aknad1E9Q8N6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Aknad1E9Q8N6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Aknad1E9Q8N6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Aknad1E9Q8N6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Aknad1E9Q8N6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Aknad1E9Q8N6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Aknad1E9Q8N6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Aknad1E9Q8N6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Aknad1E9Q8N6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Aknad1E9Q8N6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Aknad1E9Q8N6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Aknad1E9Q8N6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Aknad1E9Q8N6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Aknad1E9Q8N6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Aknad1E9Q8N6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Aknad1E9Q8N6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Aknad1E9Q8N6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Aknad1E9Q8N6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Aknad1E9Q8N6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Aknad1E9Q8N6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms