Protein–RNA interactions for Protein: E9Q512

Trip11, Thyroid hormone receptor interactor 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,976 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip11E9Q512 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trip11E9Q512 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trip11E9Q512 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trip11E9Q512 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trip11E9Q512 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trip11E9Q512 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trip11E9Q512 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Trip11E9Q512 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trip11E9Q512 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trip11E9Q512 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trip11E9Q512 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trip11E9Q512 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trip11E9Q512 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Trip11E9Q512 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trip11E9Q512 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Trip11E9Q512 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trip11E9Q512 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trip11E9Q512 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Trip11E9Q512 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trip11E9Q512 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trip11E9Q512 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Trip11E9Q512 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trip11E9Q512 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Trip11E9Q512 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trip11E9Q512 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Trip11E9Q512 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trip11E9Q512 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Trip11E9Q512 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trip11E9Q512 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trip11E9Q512 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trip11E9Q512 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Trip11E9Q512 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Trip11E9Q512 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Trip11E9Q512 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trip11E9Q512 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trip11E9Q512 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Trip11E9Q512 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Trip11E9Q512 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trip11E9Q512 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Trip11E9Q512 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trip11E9Q512 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trip11E9Q512 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Trip11E9Q512 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trip11E9Q512 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trip11E9Q512 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trip11E9Q512 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trip11E9Q512 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trip11E9Q512 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trip11E9Q512 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trip11E9Q512 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trip11E9Q512 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trip11E9Q512 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trip11E9Q512 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trip11E9Q512 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trip11E9Q512 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trip11E9Q512 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trip11E9Q512 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trip11E9Q512 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Trip11E9Q512 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trip11E9Q512 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trip11E9Q512 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trip11E9Q512 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trip11E9Q512 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Trip11E9Q512 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trip11E9Q512 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trip11E9Q512 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Trip11E9Q512 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Trip11E9Q512 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Trip11E9Q512 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trip11E9Q512 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trip11E9Q512 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Trip11E9Q512 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trip11E9Q512 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Trip11E9Q512 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trip11E9Q512 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trip11E9Q512 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trip11E9Q512 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trip11E9Q512 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trip11E9Q512 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trip11E9Q512 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trip11E9Q512 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trip11E9Q512 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Trip11E9Q512 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Trip11E9Q512 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Trip11E9Q512 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trip11E9Q512 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trip11E9Q512 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trip11E9Q512 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trip11E9Q512 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trip11E9Q512 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trip11E9Q512 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trip11E9Q512 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trip11E9Q512 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trip11E9Q512 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trip11E9Q512 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trip11E9Q512 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trip11E9Q512 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trip11E9Q512 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trip11E9Q512 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Trip11E9Q512 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms