Protein–RNA interactions for Protein: E9Q492

Pgbd1, PiggyBac transposable element-derived 1, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgbd1E9Q492 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pgbd1E9Q492 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pgbd1E9Q492 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pgbd1E9Q492 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pgbd1E9Q492 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pgbd1E9Q492 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pgbd1E9Q492 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pgbd1E9Q492 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pgbd1E9Q492 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pgbd1E9Q492 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pgbd1E9Q492 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pgbd1E9Q492 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pgbd1E9Q492 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pgbd1E9Q492 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pgbd1E9Q492 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pgbd1E9Q492 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pgbd1E9Q492 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pgbd1E9Q492 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pgbd1E9Q492 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pgbd1E9Q492 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pgbd1E9Q492 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Pgbd1E9Q492 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pgbd1E9Q492 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pgbd1E9Q492 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pgbd1E9Q492 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pgbd1E9Q492 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pgbd1E9Q492 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pgbd1E9Q492 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Pgbd1E9Q492 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pgbd1E9Q492 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pgbd1E9Q492 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pgbd1E9Q492 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pgbd1E9Q492 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pgbd1E9Q492 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pgbd1E9Q492 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pgbd1E9Q492 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pgbd1E9Q492 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pgbd1E9Q492 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pgbd1E9Q492 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pgbd1E9Q492 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Pgbd1E9Q492 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pgbd1E9Q492 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pgbd1E9Q492 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pgbd1E9Q492 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pgbd1E9Q492 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pgbd1E9Q492 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pgbd1E9Q492 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pgbd1E9Q492 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Pgbd1E9Q492 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pgbd1E9Q492 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pgbd1E9Q492 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pgbd1E9Q492 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pgbd1E9Q492 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pgbd1E9Q492 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pgbd1E9Q492 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pgbd1E9Q492 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pgbd1E9Q492 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pgbd1E9Q492 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pgbd1E9Q492 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pgbd1E9Q492 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pgbd1E9Q492 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pgbd1E9Q492 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pgbd1E9Q492 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pgbd1E9Q492 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pgbd1E9Q492 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pgbd1E9Q492 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pgbd1E9Q492 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pgbd1E9Q492 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pgbd1E9Q492 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pgbd1E9Q492 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pgbd1E9Q492 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pgbd1E9Q492 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Pgbd1E9Q492 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pgbd1E9Q492 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pgbd1E9Q492 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pgbd1E9Q492 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pgbd1E9Q492 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pgbd1E9Q492 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pgbd1E9Q492 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Pgbd1E9Q492 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pgbd1E9Q492 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pgbd1E9Q492 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pgbd1E9Q492 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pgbd1E9Q492 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pgbd1E9Q492 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pgbd1E9Q492 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pgbd1E9Q492 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pgbd1E9Q492 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pgbd1E9Q492 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pgbd1E9Q492 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pgbd1E9Q492 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pgbd1E9Q492 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pgbd1E9Q492 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Pgbd1E9Q492 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pgbd1E9Q492 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pgbd1E9Q492 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pgbd1E9Q492 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pgbd1E9Q492 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pgbd1E9Q492 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pgbd1E9Q492 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms