Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3C1

C2cd2, C2 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2cd2E9Q3C1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C2cd2E9Q3C1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
C2cd2E9Q3C1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C2cd2E9Q3C1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
C2cd2E9Q3C1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C2cd2E9Q3C1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C2cd2E9Q3C1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C2cd2E9Q3C1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C2cd2E9Q3C1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C2cd2E9Q3C1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C2cd2E9Q3C1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C2cd2E9Q3C1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C2cd2E9Q3C1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C2cd2E9Q3C1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C2cd2E9Q3C1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C2cd2E9Q3C1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C2cd2E9Q3C1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C2cd2E9Q3C1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C2cd2E9Q3C1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C2cd2E9Q3C1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C2cd2E9Q3C1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
C2cd2E9Q3C1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C2cd2E9Q3C1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C2cd2E9Q3C1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C2cd2E9Q3C1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C2cd2E9Q3C1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C2cd2E9Q3C1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C2cd2E9Q3C1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C2cd2E9Q3C1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C2cd2E9Q3C1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C2cd2E9Q3C1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C2cd2E9Q3C1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C2cd2E9Q3C1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
C2cd2E9Q3C1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C2cd2E9Q3C1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C2cd2E9Q3C1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C2cd2E9Q3C1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C2cd2E9Q3C1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C2cd2E9Q3C1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C2cd2E9Q3C1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C2cd2E9Q3C1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C2cd2E9Q3C1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C2cd2E9Q3C1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C2cd2E9Q3C1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C2cd2E9Q3C1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C2cd2E9Q3C1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C2cd2E9Q3C1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C2cd2E9Q3C1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C2cd2E9Q3C1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C2cd2E9Q3C1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C2cd2E9Q3C1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C2cd2E9Q3C1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C2cd2E9Q3C1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C2cd2E9Q3C1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C2cd2E9Q3C1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C2cd2E9Q3C1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C2cd2E9Q3C1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C2cd2E9Q3C1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C2cd2E9Q3C1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C2cd2E9Q3C1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C2cd2E9Q3C1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C2cd2E9Q3C1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C2cd2E9Q3C1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C2cd2E9Q3C1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C2cd2E9Q3C1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C2cd2E9Q3C1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C2cd2E9Q3C1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C2cd2E9Q3C1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C2cd2E9Q3C1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C2cd2E9Q3C1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C2cd2E9Q3C1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C2cd2E9Q3C1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C2cd2E9Q3C1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C2cd2E9Q3C1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C2cd2E9Q3C1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C2cd2E9Q3C1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C2cd2E9Q3C1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C2cd2E9Q3C1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C2cd2E9Q3C1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C2cd2E9Q3C1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C2cd2E9Q3C1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C2cd2E9Q3C1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C2cd2E9Q3C1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C2cd2E9Q3C1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C2cd2E9Q3C1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C2cd2E9Q3C1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C2cd2E9Q3C1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C2cd2E9Q3C1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C2cd2E9Q3C1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C2cd2E9Q3C1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C2cd2E9Q3C1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C2cd2E9Q3C1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C2cd2E9Q3C1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C2cd2E9Q3C1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C2cd2E9Q3C1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C2cd2E9Q3C1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
C2cd2E9Q3C1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C2cd2E9Q3C1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C2cd2E9Q3C1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C2cd2E9Q3C1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms