Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Tarbp1E9Q368 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Tarbp1E9Q368 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3.01
Tarbp1E9Q368 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Tarbp1E9Q368 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3.01
Tarbp1E9Q368 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Tarbp1E9Q368 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Tarbp1E9Q368 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Tarbp1E9Q368 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC33.81■■■■□ 3
Tarbp1E9Q368 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Tarbp1E9Q368 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
Tarbp1E9Q368 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Tarbp1E9Q368 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
Tarbp1E9Q368 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC33.78■■■■□ 3
Tarbp1E9Q368 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Tarbp1E9Q368 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Tarbp1E9Q368 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Tarbp1E9Q368 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Tarbp1E9Q368 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Tarbp1E9Q368 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Tarbp1E9Q368 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Tarbp1E9Q368 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Tarbp1E9Q368 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Tarbp1E9Q368 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Tarbp1E9Q368 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Tarbp1E9Q368 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
Tarbp1E9Q368 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Tarbp1E9Q368 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
Tarbp1E9Q368 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Tarbp1E9Q368 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Tarbp1E9Q368 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Tarbp1E9Q368 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Tarbp1E9Q368 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
Tarbp1E9Q368 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Tarbp1E9Q368 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Tarbp1E9Q368 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Tarbp1E9Q368 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
Tarbp1E9Q368 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
Tarbp1E9Q368 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Tarbp1E9Q368 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Tarbp1E9Q368 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Tarbp1E9Q368 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Tarbp1E9Q368 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Tarbp1E9Q368 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Tarbp1E9Q368 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Tarbp1E9Q368 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Tarbp1E9Q368 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Tarbp1E9Q368 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Tarbp1E9Q368 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
Tarbp1E9Q368 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Tarbp1E9Q368 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Tarbp1E9Q368 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Tarbp1E9Q368 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Tarbp1E9Q368 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Tarbp1E9Q368 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Tarbp1E9Q368 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Tarbp1E9Q368 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Tarbp1E9Q368 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Tarbp1E9Q368 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Tarbp1E9Q368 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
Tarbp1E9Q368 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Tarbp1E9Q368 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Tarbp1E9Q368 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Tarbp1E9Q368 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Tarbp1E9Q368 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Tarbp1E9Q368 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
Tarbp1E9Q368 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Tarbp1E9Q368 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Tarbp1E9Q368 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Tarbp1E9Q368 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Tarbp1E9Q368 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
Tarbp1E9Q368 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Tarbp1E9Q368 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Tarbp1E9Q368 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Tarbp1E9Q368 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
Tarbp1E9Q368 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Tarbp1E9Q368 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Tarbp1E9Q368 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
Tarbp1E9Q368 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Tarbp1E9Q368 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Tarbp1E9Q368 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Tarbp1E9Q368 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Tarbp1E9Q368 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Tarbp1E9Q368 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Tarbp1E9Q368 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Tarbp1E9Q368 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Tarbp1E9Q368 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Tarbp1E9Q368 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Tarbp1E9Q368 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Tarbp1E9Q368 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Tarbp1E9Q368 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Tarbp1E9Q368 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Tarbp1E9Q368 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Tarbp1E9Q368 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Tarbp1E9Q368 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Tarbp1E9Q368 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Tarbp1E9Q368 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Tarbp1E9Q368 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Tarbp1E9Q368 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Tarbp1E9Q368 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms