Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
NebE9Q1W3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
NebE9Q1W3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
NebE9Q1W3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
NebE9Q1W3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
NebE9Q1W3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
NebE9Q1W3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
NebE9Q1W3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
NebE9Q1W3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
NebE9Q1W3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
NebE9Q1W3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
NebE9Q1W3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
NebE9Q1W3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
NebE9Q1W3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
NebE9Q1W3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
NebE9Q1W3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
NebE9Q1W3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
NebE9Q1W3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
NebE9Q1W3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
NebE9Q1W3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
NebE9Q1W3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
NebE9Q1W3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
NebE9Q1W3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
NebE9Q1W3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
NebE9Q1W3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
NebE9Q1W3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
NebE9Q1W3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
NebE9Q1W3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
NebE9Q1W3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
NebE9Q1W3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
NebE9Q1W3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
NebE9Q1W3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
NebE9Q1W3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
NebE9Q1W3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
NebE9Q1W3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
NebE9Q1W3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
NebE9Q1W3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
NebE9Q1W3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
NebE9Q1W3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
NebE9Q1W3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
NebE9Q1W3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
NebE9Q1W3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
NebE9Q1W3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
NebE9Q1W3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
NebE9Q1W3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
NebE9Q1W3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
NebE9Q1W3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
NebE9Q1W3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
NebE9Q1W3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
NebE9Q1W3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
NebE9Q1W3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
NebE9Q1W3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
NebE9Q1W3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
NebE9Q1W3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NebE9Q1W3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
NebE9Q1W3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
NebE9Q1W3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NebE9Q1W3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
NebE9Q1W3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NebE9Q1W3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NebE9Q1W3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NebE9Q1W3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
NebE9Q1W3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NebE9Q1W3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NebE9Q1W3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
NebE9Q1W3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NebE9Q1W3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NebE9Q1W3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
NebE9Q1W3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NebE9Q1W3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
NebE9Q1W3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
NebE9Q1W3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NebE9Q1W3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
NebE9Q1W3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NebE9Q1W3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NebE9Q1W3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
NebE9Q1W3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NebE9Q1W3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NebE9Q1W3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
NebE9Q1W3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
NebE9Q1W3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NebE9Q1W3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NebE9Q1W3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
NebE9Q1W3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
NebE9Q1W3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NebE9Q1W3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NebE9Q1W3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NebE9Q1W3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
NebE9Q1W3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
NebE9Q1W3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NebE9Q1W3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NebE9Q1W3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
NebE9Q1W3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
NebE9Q1W3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NebE9Q1W3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
NebE9Q1W3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
NebE9Q1W3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
NebE9Q1W3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
NebE9Q1W3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
NebE9Q1W3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms