Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdzd2E9Q1M1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdzd2E9Q1M1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdzd2E9Q1M1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdzd2E9Q1M1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdzd2E9Q1M1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdzd2E9Q1M1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdzd2E9Q1M1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pdzd2E9Q1M1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pdzd2E9Q1M1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pdzd2E9Q1M1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pdzd2E9Q1M1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pdzd2E9Q1M1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pdzd2E9Q1M1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pdzd2E9Q1M1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pdzd2E9Q1M1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pdzd2E9Q1M1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pdzd2E9Q1M1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Pdzd2E9Q1M1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pdzd2E9Q1M1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pdzd2E9Q1M1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdzd2E9Q1M1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdzd2E9Q1M1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdzd2E9Q1M1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdzd2E9Q1M1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdzd2E9Q1M1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdzd2E9Q1M1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdzd2E9Q1M1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdzd2E9Q1M1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdzd2E9Q1M1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pdzd2E9Q1M1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pdzd2E9Q1M1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pdzd2E9Q1M1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pdzd2E9Q1M1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pdzd2E9Q1M1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pdzd2E9Q1M1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pdzd2E9Q1M1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pdzd2E9Q1M1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pdzd2E9Q1M1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pdzd2E9Q1M1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pdzd2E9Q1M1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pdzd2E9Q1M1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pdzd2E9Q1M1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pdzd2E9Q1M1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pdzd2E9Q1M1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pdzd2E9Q1M1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Pdzd2E9Q1M1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pdzd2E9Q1M1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pdzd2E9Q1M1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Pdzd2E9Q1M1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pdzd2E9Q1M1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pdzd2E9Q1M1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Pdzd2E9Q1M1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pdzd2E9Q1M1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pdzd2E9Q1M1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pdzd2E9Q1M1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pdzd2E9Q1M1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pdzd2E9Q1M1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pdzd2E9Q1M1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pdzd2E9Q1M1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pdzd2E9Q1M1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Pdzd2E9Q1M1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Pdzd2E9Q1M1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Pdzd2E9Q1M1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pdzd2E9Q1M1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pdzd2E9Q1M1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pdzd2E9Q1M1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pdzd2E9Q1M1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pdzd2E9Q1M1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pdzd2E9Q1M1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pdzd2E9Q1M1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pdzd2E9Q1M1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pdzd2E9Q1M1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pdzd2E9Q1M1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pdzd2E9Q1M1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pdzd2E9Q1M1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pdzd2E9Q1M1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pdzd2E9Q1M1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pdzd2E9Q1M1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pdzd2E9Q1M1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Pdzd2E9Q1M1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pdzd2E9Q1M1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pdzd2E9Q1M1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Pdzd2E9Q1M1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pdzd2E9Q1M1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pdzd2E9Q1M1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pdzd2E9Q1M1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pdzd2E9Q1M1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pdzd2E9Q1M1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pdzd2E9Q1M1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pdzd2E9Q1M1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pdzd2E9Q1M1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pdzd2E9Q1M1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pdzd2E9Q1M1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Pdzd2E9Q1M1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pdzd2E9Q1M1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pdzd2E9Q1M1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pdzd2E9Q1M1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pdzd2E9Q1M1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pdzd2E9Q1M1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 227 ms