Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ryr1E9PZQ0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ryr1E9PZQ0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ryr1E9PZQ0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ryr1E9PZQ0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ryr1E9PZQ0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ryr1E9PZQ0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ryr1E9PZQ0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ryr1E9PZQ0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ryr1E9PZQ0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ryr1E9PZQ0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ryr1E9PZQ0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ryr1E9PZQ0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ryr1E9PZQ0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ryr1E9PZQ0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ryr1E9PZQ0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ryr1E9PZQ0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ryr1E9PZQ0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ryr1E9PZQ0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ryr1E9PZQ0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ryr1E9PZQ0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Ryr1E9PZQ0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ryr1E9PZQ0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ryr1E9PZQ0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ryr1E9PZQ0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ryr1E9PZQ0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ryr1E9PZQ0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ryr1E9PZQ0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ryr1E9PZQ0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ryr1E9PZQ0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ryr1E9PZQ0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ryr1E9PZQ0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ryr1E9PZQ0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ryr1E9PZQ0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ryr1E9PZQ0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ryr1E9PZQ0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ryr1E9PZQ0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ryr1E9PZQ0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ryr1E9PZQ0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ryr1E9PZQ0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ryr1E9PZQ0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ryr1E9PZQ0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ryr1E9PZQ0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ryr1E9PZQ0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ryr1E9PZQ0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ryr1E9PZQ0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ryr1E9PZQ0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ryr1E9PZQ0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ryr1E9PZQ0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ryr1E9PZQ0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ryr1E9PZQ0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ryr1E9PZQ0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ryr1E9PZQ0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ryr1E9PZQ0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ryr1E9PZQ0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ryr1E9PZQ0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ryr1E9PZQ0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ryr1E9PZQ0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ryr1E9PZQ0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ryr1E9PZQ0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ryr1E9PZQ0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ryr1E9PZQ0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ryr1E9PZQ0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ryr1E9PZQ0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ryr1E9PZQ0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ryr1E9PZQ0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ryr1E9PZQ0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ryr1E9PZQ0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ryr1E9PZQ0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ryr1E9PZQ0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ryr1E9PZQ0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ryr1E9PZQ0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ryr1E9PZQ0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ryr1E9PZQ0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ryr1E9PZQ0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ryr1E9PZQ0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ryr1E9PZQ0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ryr1E9PZQ0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ryr1E9PZQ0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ryr1E9PZQ0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ryr1E9PZQ0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ryr1E9PZQ0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ryr1E9PZQ0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ryr1E9PZQ0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ryr1E9PZQ0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ryr1E9PZQ0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ryr1E9PZQ0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ryr1E9PZQ0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ryr1E9PZQ0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ryr1E9PZQ0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ryr1E9PZQ0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ryr1E9PZQ0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ryr1E9PZQ0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ryr1E9PZQ0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ryr1E9PZQ0 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ryr1E9PZQ0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ryr1E9PZQ0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ryr1E9PZQ0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ryr1E9PZQ0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ryr1E9PZQ0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.4 ms