Protein–RNA interactions for Protein: E9PYF4

Lmo7, LIM domain only 7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo7E9PYF4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
Lmo7E9PYF4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
Lmo7E9PYF4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Lmo7E9PYF4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Lmo7E9PYF4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
Lmo7E9PYF4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
Lmo7E9PYF4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Lmo7E9PYF4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Lmo7E9PYF4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Lmo7E9PYF4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Lmo7E9PYF4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
Lmo7E9PYF4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
Lmo7E9PYF4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Lmo7E9PYF4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.43
Lmo7E9PYF4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Lmo7E9PYF4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Lmo7E9PYF4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Lmo7E9PYF4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
Lmo7E9PYF4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Lmo7E9PYF4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Lmo7E9PYF4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Lmo7E9PYF4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Lmo7E9PYF4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Lmo7E9PYF4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
Lmo7E9PYF4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Lmo7E9PYF4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
Lmo7E9PYF4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Lmo7E9PYF4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Lmo7E9PYF4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Lmo7E9PYF4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Lmo7E9PYF4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
Lmo7E9PYF4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Lmo7E9PYF4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Lmo7E9PYF4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Lmo7E9PYF4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Lmo7E9PYF4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Lmo7E9PYF4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Lmo7E9PYF4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Lmo7E9PYF4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Lmo7E9PYF4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Lmo7E9PYF4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Lmo7E9PYF4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Lmo7E9PYF4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
Lmo7E9PYF4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Lmo7E9PYF4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Lmo7E9PYF4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC36.38■■■■□ 3.41
Lmo7E9PYF4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Lmo7E9PYF4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Lmo7E9PYF4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Lmo7E9PYF4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Lmo7E9PYF4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Lmo7E9PYF4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Lmo7E9PYF4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
Lmo7E9PYF4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Lmo7E9PYF4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Lmo7E9PYF4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Lmo7E9PYF4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Lmo7E9PYF4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
Lmo7E9PYF4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Lmo7E9PYF4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
Lmo7E9PYF4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Lmo7E9PYF4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Lmo7E9PYF4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Lmo7E9PYF4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Lmo7E9PYF4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Lmo7E9PYF4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Lmo7E9PYF4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Lmo7E9PYF4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Lmo7E9PYF4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Lmo7E9PYF4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Lmo7E9PYF4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Lmo7E9PYF4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Lmo7E9PYF4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Lmo7E9PYF4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Lmo7E9PYF4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Lmo7E9PYF4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Lmo7E9PYF4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Lmo7E9PYF4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Lmo7E9PYF4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Lmo7E9PYF4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
Lmo7E9PYF4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Lmo7E9PYF4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Lmo7E9PYF4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Lmo7E9PYF4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Lmo7E9PYF4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Lmo7E9PYF4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
Lmo7E9PYF4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Lmo7E9PYF4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Lmo7E9PYF4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Lmo7E9PYF4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Lmo7E9PYF4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Lmo7E9PYF4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Lmo7E9PYF4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Lmo7E9PYF4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Lmo7E9PYF4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Lmo7E9PYF4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
Lmo7E9PYF4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Lmo7E9PYF4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Lmo7E9PYF4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Lmo7E9PYF4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms