Protein–RNA interactions for Protein: E9PUT9

Gm3252, Predicted gene 3252, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3252E9PUT9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm3252E9PUT9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm3252E9PUT9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm3252E9PUT9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm3252E9PUT9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gm3252E9PUT9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gm3252E9PUT9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gm3252E9PUT9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gm3252E9PUT9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gm3252E9PUT9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm3252E9PUT9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm3252E9PUT9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm3252E9PUT9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm3252E9PUT9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm3252E9PUT9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm3252E9PUT9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm3252E9PUT9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm3252E9PUT9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm3252E9PUT9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gm3252E9PUT9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Gm3252E9PUT9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gm3252E9PUT9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gm3252E9PUT9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gm3252E9PUT9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm3252E9PUT9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm3252E9PUT9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm3252E9PUT9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm3252E9PUT9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm3252E9PUT9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm3252E9PUT9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm3252E9PUT9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm3252E9PUT9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm3252E9PUT9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm3252E9PUT9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm3252E9PUT9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm3252E9PUT9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm3252E9PUT9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm3252E9PUT9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm3252E9PUT9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm3252E9PUT9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm3252E9PUT9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm3252E9PUT9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm3252E9PUT9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm3252E9PUT9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm3252E9PUT9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm3252E9PUT9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm3252E9PUT9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm3252E9PUT9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm3252E9PUT9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm3252E9PUT9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm3252E9PUT9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm3252E9PUT9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm3252E9PUT9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm3252E9PUT9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm3252E9PUT9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm3252E9PUT9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm3252E9PUT9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm3252E9PUT9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm3252E9PUT9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm3252E9PUT9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm3252E9PUT9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm3252E9PUT9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm3252E9PUT9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm3252E9PUT9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm3252E9PUT9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm3252E9PUT9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm3252E9PUT9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm3252E9PUT9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm3252E9PUT9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm3252E9PUT9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm3252E9PUT9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm3252E9PUT9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm3252E9PUT9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm3252E9PUT9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm3252E9PUT9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm3252E9PUT9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm3252E9PUT9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm3252E9PUT9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm3252E9PUT9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm3252E9PUT9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm3252E9PUT9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm3252E9PUT9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm3252E9PUT9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm3252E9PUT9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm3252E9PUT9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm3252E9PUT9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm3252E9PUT9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm3252E9PUT9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm3252E9PUT9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm3252E9PUT9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm3252E9PUT9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm3252E9PUT9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm3252E9PUT9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm3252E9PUT9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm3252E9PUT9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm3252E9PUT9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm3252E9PUT9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm3252E9PUT9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm3252E9PUT9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm3252E9PUT9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms