Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Syde2E9PUP1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Syde2E9PUP1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Syde2E9PUP1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Syde2E9PUP1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Syde2E9PUP1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Syde2E9PUP1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Syde2E9PUP1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Syde2E9PUP1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Syde2E9PUP1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Syde2E9PUP1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Syde2E9PUP1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Syde2E9PUP1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
Syde2E9PUP1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Syde2E9PUP1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Syde2E9PUP1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Syde2E9PUP1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Syde2E9PUP1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Syde2E9PUP1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Syde2E9PUP1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Syde2E9PUP1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Syde2E9PUP1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Syde2E9PUP1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Syde2E9PUP1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Syde2E9PUP1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Syde2E9PUP1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Syde2E9PUP1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Syde2E9PUP1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Syde2E9PUP1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Syde2E9PUP1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Syde2E9PUP1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Syde2E9PUP1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Syde2E9PUP1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Syde2E9PUP1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Syde2E9PUP1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Syde2E9PUP1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Syde2E9PUP1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Syde2E9PUP1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Syde2E9PUP1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Syde2E9PUP1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Syde2E9PUP1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Syde2E9PUP1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Syde2E9PUP1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Syde2E9PUP1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Syde2E9PUP1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Syde2E9PUP1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Syde2E9PUP1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Syde2E9PUP1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Syde2E9PUP1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Syde2E9PUP1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Syde2E9PUP1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Syde2E9PUP1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Syde2E9PUP1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Syde2E9PUP1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Syde2E9PUP1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Syde2E9PUP1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Syde2E9PUP1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Syde2E9PUP1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Syde2E9PUP1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Syde2E9PUP1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Syde2E9PUP1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Syde2E9PUP1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Syde2E9PUP1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Syde2E9PUP1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Syde2E9PUP1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Syde2E9PUP1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Syde2E9PUP1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Syde2E9PUP1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Syde2E9PUP1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Syde2E9PUP1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Syde2E9PUP1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Syde2E9PUP1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Syde2E9PUP1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Syde2E9PUP1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Syde2E9PUP1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Syde2E9PUP1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Syde2E9PUP1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Syde2E9PUP1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Syde2E9PUP1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Syde2E9PUP1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Syde2E9PUP1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Syde2E9PUP1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Syde2E9PUP1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Syde2E9PUP1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Syde2E9PUP1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Syde2E9PUP1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Syde2E9PUP1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Syde2E9PUP1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Syde2E9PUP1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Syde2E9PUP1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Syde2E9PUP1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Syde2E9PUP1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Syde2E9PUP1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Syde2E9PUP1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Syde2E9PUP1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Syde2E9PUP1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Syde2E9PUP1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Syde2E9PUP1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Syde2E9PUP1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Syde2E9PUP1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms