Protein–RNA interactions for Protein: E1AZ71

Cngb1, Cyclic nucleotide-gated channel beta 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb1E1AZ71 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.88■■■■□ 3.98
Cngb1E1AZ71 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
Cngb1E1AZ71 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.88■■■■□ 3.97
Cngb1E1AZ71 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC39.87■■■■□ 3.97
Cngb1E1AZ71 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
Cngb1E1AZ71 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.86■■■■□ 3.97
Cngb1E1AZ71 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
Cngb1E1AZ71 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
Cngb1E1AZ71 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
Cngb1E1AZ71 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.83■■■■□ 3.97
Cngb1E1AZ71 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC39.82■■■■□ 3.97
Cngb1E1AZ71 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
Cngb1E1AZ71 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
Cngb1E1AZ71 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
Cngb1E1AZ71 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
Cngb1E1AZ71 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
Cngb1E1AZ71 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC39.78■■■■□ 3.96
Cngb1E1AZ71 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC39.78■■■■□ 3.96
Cngb1E1AZ71 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
Cngb1E1AZ71 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
Cngb1E1AZ71 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
Cngb1E1AZ71 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
Cngb1E1AZ71 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
Cngb1E1AZ71 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
Cngb1E1AZ71 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
Cngb1E1AZ71 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
Cngb1E1AZ71 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
Cngb1E1AZ71 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC39.73■■■■□ 3.95
Cngb1E1AZ71 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
Cngb1E1AZ71 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
Cngb1E1AZ71 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC39.7■■■■□ 3.95
Cngb1E1AZ71 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
Cngb1E1AZ71 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
Cngb1E1AZ71 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
Cngb1E1AZ71 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC39.67■■■■□ 3.94
Cngb1E1AZ71 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
Cngb1E1AZ71 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
Cngb1E1AZ71 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
Cngb1E1AZ71 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC39.64■■■■□ 3.94
Cngb1E1AZ71 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
Cngb1E1AZ71 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
Cngb1E1AZ71 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC39.62■■■■□ 3.93
Cngb1E1AZ71 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
Cngb1E1AZ71 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
Cngb1E1AZ71 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
Cngb1E1AZ71 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.6■■■■□ 3.93
Cngb1E1AZ71 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
Cngb1E1AZ71 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC39.6■■■■□ 3.93
Cngb1E1AZ71 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
Cngb1E1AZ71 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
Cngb1E1AZ71 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC39.58■■■■□ 3.93
Cngb1E1AZ71 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
Cngb1E1AZ71 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC39.57■■■■□ 3.93
Cngb1E1AZ71 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC39.57■■■■□ 3.92
Cngb1E1AZ71 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.56■■■■□ 3.92
Cngb1E1AZ71 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
Cngb1E1AZ71 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
Cngb1E1AZ71 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC39.56■■■■□ 3.92
Cngb1E1AZ71 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
Cngb1E1AZ71 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.55■■■■□ 3.92
Cngb1E1AZ71 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
Cngb1E1AZ71 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
Cngb1E1AZ71 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
Cngb1E1AZ71 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC39.54■■■■□ 3.92
Cngb1E1AZ71 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC39.54■■■■□ 3.92
Cngb1E1AZ71 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
Cngb1E1AZ71 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
Cngb1E1AZ71 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC39.53■■■■□ 3.92
Cngb1E1AZ71 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
Cngb1E1AZ71 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
Cngb1E1AZ71 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
Cngb1E1AZ71 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC39.52■■■■□ 3.92
Cngb1E1AZ71 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
Cngb1E1AZ71 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
Cngb1E1AZ71 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.51■■■■□ 3.92
Cngb1E1AZ71 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC39.5■■■■□ 3.91
Cngb1E1AZ71 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
Cngb1E1AZ71 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
Cngb1E1AZ71 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC39.5■■■■□ 3.91
Cngb1E1AZ71 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
Cngb1E1AZ71 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
Cngb1E1AZ71 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
Cngb1E1AZ71 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
Cngb1E1AZ71 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC39.46■■■■□ 3.91
Cngb1E1AZ71 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC39.45■■■■□ 3.91
Cngb1E1AZ71 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
Cngb1E1AZ71 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC39.45■■■■□ 3.91
Cngb1E1AZ71 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
Cngb1E1AZ71 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
Cngb1E1AZ71 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
Cngb1E1AZ71 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
Cngb1E1AZ71 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
Cngb1E1AZ71 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
Cngb1E1AZ71 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
Cngb1E1AZ71 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
Cngb1E1AZ71 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC39.42■■■■□ 3.9
Cngb1E1AZ71 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
Cngb1E1AZ71 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
Cngb1E1AZ71 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
Cngb1E1AZ71 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC39.4■■■■□ 3.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms