Protein–RNA interactions for Protein: D3Z741

4930444G20Rik, RIKEN cDNA 4930444G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930444G20RikD3Z741 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
4930444G20RikD3Z741 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
4930444G20RikD3Z741 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
4930444G20RikD3Z741 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
4930444G20RikD3Z741 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
4930444G20RikD3Z741 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
4930444G20RikD3Z741 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
4930444G20RikD3Z741 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
4930444G20RikD3Z741 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
4930444G20RikD3Z741 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
4930444G20RikD3Z741 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
4930444G20RikD3Z741 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
4930444G20RikD3Z741 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
4930444G20RikD3Z741 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
4930444G20RikD3Z741 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
4930444G20RikD3Z741 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
4930444G20RikD3Z741 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
4930444G20RikD3Z741 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
4930444G20RikD3Z741 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4930444G20RikD3Z741 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
4930444G20RikD3Z741 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4930444G20RikD3Z741 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4930444G20RikD3Z741 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4930444G20RikD3Z741 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
4930444G20RikD3Z741 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
4930444G20RikD3Z741 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
4930444G20RikD3Z741 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
4930444G20RikD3Z741 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
4930444G20RikD3Z741 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
4930444G20RikD3Z741 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
4930444G20RikD3Z741 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
4930444G20RikD3Z741 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
4930444G20RikD3Z741 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
4930444G20RikD3Z741 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
4930444G20RikD3Z741 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
4930444G20RikD3Z741 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
4930444G20RikD3Z741 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
4930444G20RikD3Z741 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
4930444G20RikD3Z741 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
4930444G20RikD3Z741 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
4930444G20RikD3Z741 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
4930444G20RikD3Z741 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
4930444G20RikD3Z741 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
4930444G20RikD3Z741 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
4930444G20RikD3Z741 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4930444G20RikD3Z741 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
4930444G20RikD3Z741 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
4930444G20RikD3Z741 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4930444G20RikD3Z741 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
4930444G20RikD3Z741 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
4930444G20RikD3Z741 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
4930444G20RikD3Z741 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
4930444G20RikD3Z741 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
4930444G20RikD3Z741 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
4930444G20RikD3Z741 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
4930444G20RikD3Z741 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
4930444G20RikD3Z741 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
4930444G20RikD3Z741 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
4930444G20RikD3Z741 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
4930444G20RikD3Z741 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
4930444G20RikD3Z741 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
4930444G20RikD3Z741 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
4930444G20RikD3Z741 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
4930444G20RikD3Z741 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
4930444G20RikD3Z741 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
4930444G20RikD3Z741 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
4930444G20RikD3Z741 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
4930444G20RikD3Z741 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
4930444G20RikD3Z741 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
4930444G20RikD3Z741 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
4930444G20RikD3Z741 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
4930444G20RikD3Z741 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
4930444G20RikD3Z741 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
4930444G20RikD3Z741 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
4930444G20RikD3Z741 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
4930444G20RikD3Z741 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
4930444G20RikD3Z741 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
4930444G20RikD3Z741 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
4930444G20RikD3Z741 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
4930444G20RikD3Z741 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
4930444G20RikD3Z741 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
4930444G20RikD3Z741 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
4930444G20RikD3Z741 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
4930444G20RikD3Z741 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
4930444G20RikD3Z741 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
4930444G20RikD3Z741 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
4930444G20RikD3Z741 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
4930444G20RikD3Z741 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
4930444G20RikD3Z741 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
4930444G20RikD3Z741 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
4930444G20RikD3Z741 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
4930444G20RikD3Z741 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
4930444G20RikD3Z741 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
4930444G20RikD3Z741 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
4930444G20RikD3Z741 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
4930444G20RikD3Z741 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
4930444G20RikD3Z741 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
4930444G20RikD3Z741 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
4930444G20RikD3Z741 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
4930444G20RikD3Z741 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms