Protein–RNA interactions for Protein: D3YY23

Lonrf1, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 762 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf1D3YY23 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lonrf1D3YY23 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lonrf1D3YY23 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lonrf1D3YY23 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lonrf1D3YY23 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lonrf1D3YY23 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lonrf1D3YY23 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lonrf1D3YY23 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lonrf1D3YY23 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lonrf1D3YY23 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lonrf1D3YY23 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lonrf1D3YY23 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lonrf1D3YY23 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lonrf1D3YY23 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lonrf1D3YY23 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lonrf1D3YY23 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lonrf1D3YY23 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lonrf1D3YY23 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lonrf1D3YY23 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lonrf1D3YY23 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lonrf1D3YY23 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lonrf1D3YY23 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lonrf1D3YY23 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lonrf1D3YY23 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lonrf1D3YY23 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lonrf1D3YY23 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lonrf1D3YY23 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lonrf1D3YY23 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lonrf1D3YY23 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lonrf1D3YY23 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lonrf1D3YY23 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lonrf1D3YY23 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lonrf1D3YY23 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lonrf1D3YY23 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lonrf1D3YY23 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lonrf1D3YY23 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lonrf1D3YY23 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lonrf1D3YY23 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lonrf1D3YY23 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lonrf1D3YY23 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lonrf1D3YY23 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lonrf1D3YY23 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lonrf1D3YY23 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lonrf1D3YY23 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lonrf1D3YY23 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lonrf1D3YY23 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lonrf1D3YY23 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lonrf1D3YY23 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Lonrf1D3YY23 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Lonrf1D3YY23 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lonrf1D3YY23 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lonrf1D3YY23 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lonrf1D3YY23 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lonrf1D3YY23 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lonrf1D3YY23 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lonrf1D3YY23 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lonrf1D3YY23 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lonrf1D3YY23 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lonrf1D3YY23 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lonrf1D3YY23 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lonrf1D3YY23 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lonrf1D3YY23 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lonrf1D3YY23 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lonrf1D3YY23 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lonrf1D3YY23 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lonrf1D3YY23 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lonrf1D3YY23 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lonrf1D3YY23 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lonrf1D3YY23 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lonrf1D3YY23 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Lonrf1D3YY23 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lonrf1D3YY23 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Lonrf1D3YY23 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lonrf1D3YY23 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lonrf1D3YY23 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Lonrf1D3YY23 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lonrf1D3YY23 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lonrf1D3YY23 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lonrf1D3YY23 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lonrf1D3YY23 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lonrf1D3YY23 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lonrf1D3YY23 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lonrf1D3YY23 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lonrf1D3YY23 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lonrf1D3YY23 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lonrf1D3YY23 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lonrf1D3YY23 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lonrf1D3YY23 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lonrf1D3YY23 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lonrf1D3YY23 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lonrf1D3YY23 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lonrf1D3YY23 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lonrf1D3YY23 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lonrf1D3YY23 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lonrf1D3YY23 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Lonrf1D3YY23 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lonrf1D3YY23 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lonrf1D3YY23 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lonrf1D3YY23 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lonrf1D3YY23 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms