Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trabd2bB1ATG9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trabd2bB1ATG9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Trabd2bB1ATG9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trabd2bB1ATG9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trabd2bB1ATG9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Trabd2bB1ATG9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trabd2bB1ATG9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trabd2bB1ATG9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trabd2bB1ATG9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trabd2bB1ATG9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trabd2bB1ATG9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trabd2bB1ATG9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trabd2bB1ATG9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Trabd2bB1ATG9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trabd2bB1ATG9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trabd2bB1ATG9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trabd2bB1ATG9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trabd2bB1ATG9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trabd2bB1ATG9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trabd2bB1ATG9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trabd2bB1ATG9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trabd2bB1ATG9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Trabd2bB1ATG9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trabd2bB1ATG9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trabd2bB1ATG9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trabd2bB1ATG9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trabd2bB1ATG9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trabd2bB1ATG9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trabd2bB1ATG9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trabd2bB1ATG9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trabd2bB1ATG9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trabd2bB1ATG9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trabd2bB1ATG9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Trabd2bB1ATG9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trabd2bB1ATG9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trabd2bB1ATG9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trabd2bB1ATG9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trabd2bB1ATG9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trabd2bB1ATG9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trabd2bB1ATG9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Trabd2bB1ATG9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trabd2bB1ATG9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trabd2bB1ATG9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trabd2bB1ATG9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trabd2bB1ATG9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trabd2bB1ATG9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trabd2bB1ATG9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trabd2bB1ATG9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trabd2bB1ATG9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Trabd2bB1ATG9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trabd2bB1ATG9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trabd2bB1ATG9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trabd2bB1ATG9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trabd2bB1ATG9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trabd2bB1ATG9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trabd2bB1ATG9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trabd2bB1ATG9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trabd2bB1ATG9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trabd2bB1ATG9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trabd2bB1ATG9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trabd2bB1ATG9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trabd2bB1ATG9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trabd2bB1ATG9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trabd2bB1ATG9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trabd2bB1ATG9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Trabd2bB1ATG9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trabd2bB1ATG9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trabd2bB1ATG9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trabd2bB1ATG9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trabd2bB1ATG9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trabd2bB1ATG9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trabd2bB1ATG9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trabd2bB1ATG9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Trabd2bB1ATG9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Trabd2bB1ATG9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trabd2bB1ATG9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Trabd2bB1ATG9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trabd2bB1ATG9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trabd2bB1ATG9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trabd2bB1ATG9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Trabd2bB1ATG9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Trabd2bB1ATG9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trabd2bB1ATG9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trabd2bB1ATG9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trabd2bB1ATG9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trabd2bB1ATG9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trabd2bB1ATG9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trabd2bB1ATG9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trabd2bB1ATG9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trabd2bB1ATG9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trabd2bB1ATG9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trabd2bB1ATG9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Trabd2bB1ATG9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trabd2bB1ATG9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trabd2bB1ATG9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trabd2bB1ATG9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trabd2bB1ATG9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trabd2bB1ATG9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trabd2bB1ATG9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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