Protein–RNA interactions for Protein: B1AQB0

Gm11596, MCG140213, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11596B1AQB0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm11596B1AQB0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm11596B1AQB0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm11596B1AQB0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm11596B1AQB0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm11596B1AQB0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm11596B1AQB0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm11596B1AQB0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm11596B1AQB0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm11596B1AQB0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm11596B1AQB0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm11596B1AQB0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm11596B1AQB0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm11596B1AQB0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm11596B1AQB0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm11596B1AQB0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm11596B1AQB0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm11596B1AQB0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm11596B1AQB0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm11596B1AQB0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm11596B1AQB0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm11596B1AQB0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm11596B1AQB0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm11596B1AQB0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm11596B1AQB0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm11596B1AQB0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm11596B1AQB0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm11596B1AQB0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm11596B1AQB0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm11596B1AQB0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm11596B1AQB0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm11596B1AQB0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm11596B1AQB0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm11596B1AQB0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm11596B1AQB0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm11596B1AQB0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm11596B1AQB0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm11596B1AQB0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm11596B1AQB0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm11596B1AQB0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm11596B1AQB0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm11596B1AQB0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm11596B1AQB0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm11596B1AQB0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm11596B1AQB0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm11596B1AQB0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm11596B1AQB0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm11596B1AQB0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm11596B1AQB0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm11596B1AQB0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm11596B1AQB0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm11596B1AQB0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm11596B1AQB0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm11596B1AQB0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm11596B1AQB0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm11596B1AQB0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm11596B1AQB0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm11596B1AQB0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm11596B1AQB0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm11596B1AQB0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm11596B1AQB0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm11596B1AQB0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm11596B1AQB0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm11596B1AQB0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm11596B1AQB0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm11596B1AQB0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm11596B1AQB0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm11596B1AQB0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm11596B1AQB0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm11596B1AQB0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm11596B1AQB0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm11596B1AQB0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm11596B1AQB0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm11596B1AQB0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm11596B1AQB0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm11596B1AQB0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm11596B1AQB0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm11596B1AQB0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm11596B1AQB0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm11596B1AQB0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm11596B1AQB0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm11596B1AQB0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm11596B1AQB0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm11596B1AQB0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm11596B1AQB0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm11596B1AQB0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm11596B1AQB0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm11596B1AQB0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm11596B1AQB0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm11596B1AQB0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm11596B1AQB0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm11596B1AQB0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm11596B1AQB0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm11596B1AQB0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm11596B1AQB0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm11596B1AQB0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm11596B1AQB0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm11596B1AQB0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm11596B1AQB0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm11596B1AQB0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms