Protein–RNA interactions for Protein: A9Q751

Cfap221, Cilia- and flagella-associated protein 221, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap221A9Q751 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cfap221A9Q751 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cfap221A9Q751 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cfap221A9Q751 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cfap221A9Q751 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cfap221A9Q751 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cfap221A9Q751 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cfap221A9Q751 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cfap221A9Q751 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cfap221A9Q751 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cfap221A9Q751 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cfap221A9Q751 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cfap221A9Q751 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cfap221A9Q751 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cfap221A9Q751 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cfap221A9Q751 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cfap221A9Q751 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cfap221A9Q751 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cfap221A9Q751 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cfap221A9Q751 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cfap221A9Q751 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cfap221A9Q751 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cfap221A9Q751 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cfap221A9Q751 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cfap221A9Q751 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cfap221A9Q751 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cfap221A9Q751 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cfap221A9Q751 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cfap221A9Q751 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cfap221A9Q751 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cfap221A9Q751 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cfap221A9Q751 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cfap221A9Q751 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Cfap221A9Q751 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cfap221A9Q751 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cfap221A9Q751 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cfap221A9Q751 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cfap221A9Q751 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cfap221A9Q751 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cfap221A9Q751 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cfap221A9Q751 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cfap221A9Q751 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cfap221A9Q751 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cfap221A9Q751 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cfap221A9Q751 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cfap221A9Q751 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cfap221A9Q751 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cfap221A9Q751 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cfap221A9Q751 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cfap221A9Q751 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cfap221A9Q751 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cfap221A9Q751 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cfap221A9Q751 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cfap221A9Q751 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cfap221A9Q751 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cfap221A9Q751 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cfap221A9Q751 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cfap221A9Q751 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cfap221A9Q751 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cfap221A9Q751 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cfap221A9Q751 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cfap221A9Q751 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cfap221A9Q751 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cfap221A9Q751 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cfap221A9Q751 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cfap221A9Q751 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cfap221A9Q751 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cfap221A9Q751 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cfap221A9Q751 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cfap221A9Q751 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cfap221A9Q751 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cfap221A9Q751 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cfap221A9Q751 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cfap221A9Q751 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cfap221A9Q751 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cfap221A9Q751 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cfap221A9Q751 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cfap221A9Q751 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cfap221A9Q751 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cfap221A9Q751 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cfap221A9Q751 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cfap221A9Q751 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cfap221A9Q751 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Cfap221A9Q751 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cfap221A9Q751 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cfap221A9Q751 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cfap221A9Q751 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cfap221A9Q751 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cfap221A9Q751 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cfap221A9Q751 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cfap221A9Q751 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cfap221A9Q751 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cfap221A9Q751 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cfap221A9Q751 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cfap221A9Q751 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cfap221A9Q751 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cfap221A9Q751 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cfap221A9Q751 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cfap221A9Q751 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cfap221A9Q751 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms