Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PtprfA2A8L5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PtprfA2A8L5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PtprfA2A8L5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PtprfA2A8L5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PtprfA2A8L5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PtprfA2A8L5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PtprfA2A8L5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PtprfA2A8L5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtprfA2A8L5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PtprfA2A8L5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PtprfA2A8L5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprfA2A8L5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprfA2A8L5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprfA2A8L5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PtprfA2A8L5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PtprfA2A8L5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PtprfA2A8L5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PtprfA2A8L5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PtprfA2A8L5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PtprfA2A8L5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PtprfA2A8L5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtprfA2A8L5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtprfA2A8L5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtprfA2A8L5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
PtprfA2A8L5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PtprfA2A8L5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtprfA2A8L5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtprfA2A8L5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtprfA2A8L5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtprfA2A8L5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PtprfA2A8L5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtprfA2A8L5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PtprfA2A8L5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtprfA2A8L5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtprfA2A8L5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtprfA2A8L5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtprfA2A8L5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtprfA2A8L5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtprfA2A8L5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtprfA2A8L5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtprfA2A8L5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtprfA2A8L5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtprfA2A8L5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtprfA2A8L5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtprfA2A8L5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtprfA2A8L5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PtprfA2A8L5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprfA2A8L5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprfA2A8L5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PtprfA2A8L5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PtprfA2A8L5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PtprfA2A8L5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtprfA2A8L5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtprfA2A8L5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtprfA2A8L5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprfA2A8L5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprfA2A8L5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprfA2A8L5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprfA2A8L5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprfA2A8L5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprfA2A8L5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprfA2A8L5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprfA2A8L5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtprfA2A8L5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtprfA2A8L5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtprfA2A8L5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtprfA2A8L5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtprfA2A8L5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtprfA2A8L5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtprfA2A8L5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtprfA2A8L5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtprfA2A8L5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtprfA2A8L5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtprfA2A8L5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtprfA2A8L5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PtprfA2A8L5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PtprfA2A8L5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtprfA2A8L5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtprfA2A8L5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtprfA2A8L5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtprfA2A8L5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprfA2A8L5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprfA2A8L5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprfA2A8L5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprfA2A8L5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprfA2A8L5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprfA2A8L5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprfA2A8L5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprfA2A8L5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtprfA2A8L5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtprfA2A8L5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PtprfA2A8L5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PtprfA2A8L5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PtprfA2A8L5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PtprfA2A8L5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PtprfA2A8L5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PtprfA2A8L5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PtprfA2A8L5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PtprfA2A8L5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms