Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L1

Chd5, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd5A2A8L1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Chd5A2A8L1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Chd5A2A8L1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Chd5A2A8L1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Chd5A2A8L1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Chd5A2A8L1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Chd5A2A8L1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Chd5A2A8L1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Chd5A2A8L1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Chd5A2A8L1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Chd5A2A8L1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Chd5A2A8L1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Chd5A2A8L1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Chd5A2A8L1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Chd5A2A8L1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Chd5A2A8L1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Chd5A2A8L1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Chd5A2A8L1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Chd5A2A8L1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Chd5A2A8L1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Chd5A2A8L1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Chd5A2A8L1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Chd5A2A8L1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Chd5A2A8L1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Chd5A2A8L1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Chd5A2A8L1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Chd5A2A8L1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Chd5A2A8L1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Chd5A2A8L1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Chd5A2A8L1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Chd5A2A8L1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Chd5A2A8L1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Chd5A2A8L1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Chd5A2A8L1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Chd5A2A8L1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Chd5A2A8L1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Chd5A2A8L1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Chd5A2A8L1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Chd5A2A8L1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Chd5A2A8L1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Chd5A2A8L1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Chd5A2A8L1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Chd5A2A8L1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Chd5A2A8L1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Chd5A2A8L1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Chd5A2A8L1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Chd5A2A8L1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Chd5A2A8L1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Chd5A2A8L1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Chd5A2A8L1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Chd5A2A8L1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Chd5A2A8L1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Chd5A2A8L1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Chd5A2A8L1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Chd5A2A8L1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Chd5A2A8L1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Chd5A2A8L1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Chd5A2A8L1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Chd5A2A8L1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Chd5A2A8L1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Chd5A2A8L1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Chd5A2A8L1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Chd5A2A8L1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Chd5A2A8L1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Chd5A2A8L1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Chd5A2A8L1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Chd5A2A8L1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Chd5A2A8L1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Chd5A2A8L1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Chd5A2A8L1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Chd5A2A8L1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Chd5A2A8L1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Chd5A2A8L1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Chd5A2A8L1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Chd5A2A8L1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Chd5A2A8L1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Chd5A2A8L1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Chd5A2A8L1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Chd5A2A8L1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Chd5A2A8L1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Chd5A2A8L1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Chd5A2A8L1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Chd5A2A8L1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Chd5A2A8L1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Chd5A2A8L1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Chd5A2A8L1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Chd5A2A8L1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Chd5A2A8L1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Chd5A2A8L1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Chd5A2A8L1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Chd5A2A8L1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Chd5A2A8L1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Chd5A2A8L1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Chd5A2A8L1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Chd5A2A8L1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Chd5A2A8L1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Chd5A2A8L1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Chd5A2A8L1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Chd5A2A8L1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Chd5A2A8L1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms