Protein–RNA interactions for Protein: A1L3C1

Fam71e1, Protein FAM71E1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71e1A1L3C1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Fam71e1A1L3C1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Fam71e1A1L3C1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Fam71e1A1L3C1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Fam71e1A1L3C1 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Fam71e1A1L3C1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Fam71e1A1L3C1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Fam71e1A1L3C1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Fam71e1A1L3C1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Fam71e1A1L3C1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Fam71e1A1L3C1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Fam71e1A1L3C1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Fam71e1A1L3C1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Fam71e1A1L3C1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Fam71e1A1L3C1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Fam71e1A1L3C1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Fam71e1A1L3C1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Fam71e1A1L3C1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Fam71e1A1L3C1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Fam71e1A1L3C1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Fam71e1A1L3C1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Fam71e1A1L3C1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Fam71e1A1L3C1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Fam71e1A1L3C1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Fam71e1A1L3C1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Fam71e1A1L3C1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Fam71e1A1L3C1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Fam71e1A1L3C1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Fam71e1A1L3C1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Fam71e1A1L3C1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Fam71e1A1L3C1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Fam71e1A1L3C1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Fam71e1A1L3C1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Fam71e1A1L3C1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Fam71e1A1L3C1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Fam71e1A1L3C1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Fam71e1A1L3C1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Fam71e1A1L3C1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Fam71e1A1L3C1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Fam71e1A1L3C1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Fam71e1A1L3C1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Fam71e1A1L3C1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Fam71e1A1L3C1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Fam71e1A1L3C1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Fam71e1A1L3C1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Fam71e1A1L3C1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Fam71e1A1L3C1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Fam71e1A1L3C1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Fam71e1A1L3C1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Fam71e1A1L3C1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Fam71e1A1L3C1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Fam71e1A1L3C1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Fam71e1A1L3C1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Fam71e1A1L3C1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Fam71e1A1L3C1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Fam71e1A1L3C1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Fam71e1A1L3C1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Fam71e1A1L3C1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Fam71e1A1L3C1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Fam71e1A1L3C1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Fam71e1A1L3C1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Fam71e1A1L3C1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Fam71e1A1L3C1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Fam71e1A1L3C1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Fam71e1A1L3C1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Fam71e1A1L3C1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Fam71e1A1L3C1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Fam71e1A1L3C1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Fam71e1A1L3C1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Fam71e1A1L3C1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Fam71e1A1L3C1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Fam71e1A1L3C1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Fam71e1A1L3C1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Fam71e1A1L3C1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Fam71e1A1L3C1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Fam71e1A1L3C1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Fam71e1A1L3C1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Fam71e1A1L3C1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Fam71e1A1L3C1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Fam71e1A1L3C1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Fam71e1A1L3C1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Fam71e1A1L3C1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Fam71e1A1L3C1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Fam71e1A1L3C1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Fam71e1A1L3C1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Fam71e1A1L3C1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Fam71e1A1L3C1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Fam71e1A1L3C1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Fam71e1A1L3C1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Fam71e1A1L3C1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Fam71e1A1L3C1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Fam71e1A1L3C1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Fam71e1A1L3C1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Fam71e1A1L3C1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Fam71e1A1L3C1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Fam71e1A1L3C1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Fam71e1A1L3C1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Fam71e1A1L3C1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Fam71e1A1L3C1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Fam71e1A1L3C1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms