Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YY38

Ighv1-42, Immunoglobulin heavy variable V1-42 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-42A0A0A6YY38 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ighv1-42A0A0A6YY38 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ighv1-42A0A0A6YY38 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ighv1-42A0A0A6YY38 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ighv1-42A0A0A6YY38 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ighv1-42A0A0A6YY38 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ighv1-42A0A0A6YY38 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ighv1-42A0A0A6YY38 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ighv1-42A0A0A6YY38 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ighv1-42A0A0A6YY38 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ighv1-42A0A0A6YY38 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ighv1-42A0A0A6YY38 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ighv1-42A0A0A6YY38 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ighv1-42A0A0A6YY38 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ighv1-42A0A0A6YY38 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ighv1-42A0A0A6YY38 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ighv1-42A0A0A6YY38 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ighv1-42A0A0A6YY38 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ighv1-42A0A0A6YY38 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ighv1-42A0A0A6YY38 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ighv1-42A0A0A6YY38 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ighv1-42A0A0A6YY38 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ighv1-42A0A0A6YY38 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ighv1-42A0A0A6YY38 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ighv1-42A0A0A6YY38 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ighv1-42A0A0A6YY38 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ighv1-42A0A0A6YY38 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ighv1-42A0A0A6YY38 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ighv1-42A0A0A6YY38 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ighv1-42A0A0A6YY38 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ighv1-42A0A0A6YY38 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ighv1-42A0A0A6YY38 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ighv1-42A0A0A6YY38 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ighv1-42A0A0A6YY38 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ighv1-42A0A0A6YY38 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ighv1-42A0A0A6YY38 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ighv1-42A0A0A6YY38 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ighv1-42A0A0A6YY38 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ighv1-42A0A0A6YY38 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ighv1-42A0A0A6YY38 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ighv1-42A0A0A6YY38 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ighv1-42A0A0A6YY38 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ighv1-42A0A0A6YY38 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ighv1-42A0A0A6YY38 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ighv1-42A0A0A6YY38 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ighv1-42A0A0A6YY38 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ighv1-42A0A0A6YY38 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ighv1-42A0A0A6YY38 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ighv1-42A0A0A6YY38 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ighv1-42A0A0A6YY38 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ighv1-42A0A0A6YY38 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ighv1-42A0A0A6YY38 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ighv1-42A0A0A6YY38 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ighv1-42A0A0A6YY38 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ighv1-42A0A0A6YY38 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ighv1-42A0A0A6YY38 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ighv1-42A0A0A6YY38 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ighv1-42A0A0A6YY38 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ighv1-42A0A0A6YY38 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ighv1-42A0A0A6YY38 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ighv1-42A0A0A6YY38 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ighv1-42A0A0A6YY38 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ighv1-42A0A0A6YY38 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ighv1-42A0A0A6YY38 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ighv1-42A0A0A6YY38 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ighv1-42A0A0A6YY38 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ighv1-42A0A0A6YY38 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ighv1-42A0A0A6YY38 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ighv1-42A0A0A6YY38 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ighv1-42A0A0A6YY38 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ighv1-42A0A0A6YY38 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ighv1-42A0A0A6YY38 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ighv1-42A0A0A6YY38 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ighv1-42A0A0A6YY38 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ighv1-42A0A0A6YY38 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ighv1-42A0A0A6YY38 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ighv1-42A0A0A6YY38 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ighv1-42A0A0A6YY38 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ighv1-42A0A0A6YY38 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ighv1-42A0A0A6YY38 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ighv1-42A0A0A6YY38 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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