Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
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RABGEF1Q9UJ41 AL137186.1-201ENST00000440436 480 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 AC002553.3-201ENST00000453002 341 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
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RABGEF1Q9UJ41 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
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RABGEF1Q9UJ41 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
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