Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
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CTXN3Q4LDR2 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CTXN3Q4LDR2 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
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