Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
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FXNQ16595 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FXNQ16595 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
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FXNQ16595 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FXNQ16595 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
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FXNQ16595 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
FXNQ16595 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FXNQ16595 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
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FXNQ16595 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
FXNQ16595 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
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FXNQ16595 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
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FXNQ16595 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
FXNQ16595 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
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FXNQ16595 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FXNQ16595 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FXNQ16595 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
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