Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
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DDB1Q16531 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
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DDB1Q16531 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
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DDB1Q16531 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
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DDB1Q16531 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
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DDB1Q16531 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
DDB1Q16531 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
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