Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC1.53□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC1.53□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC1.53□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC1.53□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC1.53□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC1.53□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC1.53□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 CAPZA2-212ENST00000490693 809 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 AL513343.1-201ENST00000451818 792 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZFHX3Q15911 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
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