Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC1.33□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC1.33□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 AL022310.1-201ENST00000436974 690 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 AC092131.1-201ENST00000564046 548 ntTSL 4 BASIC1.32□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 NDUFAF4P2-201ENST00000445374 520 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC1.3□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC1.3□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 AL442163.2-201ENST00000553912 710 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 NTAN1P1-201ENST00000603150 646 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
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