Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TTF1Q15361 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.8 ms