Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
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ITGA9Q13797 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
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ITGA9Q13797 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
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ITGA9Q13797 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC3.33□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ITGA9Q13797 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
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