Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
APOFQ13790 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
APOFQ13790 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC2.1□□□□□ -2.07
APOFQ13790 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
APOFQ13790 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
APOFQ13790 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
APOFQ13790 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
APOFQ13790 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
APOFQ13790 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
APOFQ13790 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
APOFQ13790 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
APOFQ13790 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
APOFQ13790 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
APOFQ13790 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
APOFQ13790 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
APOFQ13790 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
APOFQ13790 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
APOFQ13790 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
APOFQ13790 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
APOFQ13790 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
APOFQ13790 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
APOFQ13790 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
APOFQ13790 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
APOFQ13790 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
APOFQ13790 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
APOFQ13790 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
APOFQ13790 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
APOFQ13790 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AC069306.1-201ENST00000507006 843 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
APOFQ13790 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
APOFQ13790 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
APOFQ13790 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
APOFQ13790 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC2.09□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
APOFQ13790 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
APOFQ13790 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.08
APOFQ13790 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
APOFQ13790 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
APOFQ13790 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
APOFQ13790 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
APOFQ13790 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
APOFQ13790 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
APOFQ13790 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
APOFQ13790 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
APOFQ13790 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
APOFQ13790 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
APOFQ13790 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
APOFQ13790 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
APOFQ13790 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
APOFQ13790 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
APOFQ13790 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
APOFQ13790 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
APOFQ13790 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
APOFQ13790 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
APOFQ13790 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
APOFQ13790 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
APOFQ13790 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
APOFQ13790 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
APOFQ13790 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
APOFQ13790 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
APOFQ13790 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
APOFQ13790 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.08□□□□□ -2.08
APOFQ13790 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
APOFQ13790 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
APOFQ13790 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
APOFQ13790 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
APOFQ13790 SNRPGP1-201ENST00000553864 222 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
APOFQ13790 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
APOFQ13790 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms