Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 DEFB122-201ENST00000433453 499 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.94□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC1.94□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC1.94□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC1.94□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC1.93□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 AL121578.1-201ENST00000428051 892 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
KRR1Q13601 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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