Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
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FOXE3Q13461 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
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FOXE3Q13461 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
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FOXE3Q13461 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
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FOXE3Q13461 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
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FOXE3Q13461 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
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FOXE3Q13461 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
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FOXE3Q13461 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
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FOXE3Q13461 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
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FOXE3Q13461 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
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FOXE3Q13461 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
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FOXE3Q13461 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
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