Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 OR52A4P-203ENST00000498233 1014 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.2 ms