Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 RNU6-362P-201ENST00000516736 90 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 AC113420.1-201ENST00000507903 571 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SKP2Q13309 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms