Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 AC025181.1-201ENST00000477507 416 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SRSF6Q13247 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.4 ms