Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
APOBRQ0VD83 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
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